重組質(zhì)粒構建是常用的分子生物學(xué)手段,其實(shí)只是最基本的方法,一般一個(gè)星期同時(shí)構建三二個(gè)組質(zhì)粒是沒(méi)有問(wèn)題的。在國內先進(jìn)的實(shí)驗中,也大都是由實(shí)驗員搞定。但是其中還是有些基本的技巧需要掌握。在這里將我的心得分享于大家,這也是我本人幾年來(lái)一線(xiàn)工作時(shí)的經(jīng)驗積累,以期能為谷友提供借鑒,讓大家在實(shí)驗中少走彎路。所涉及內容如下:
1) 克隆基因的酶切位點(diǎn)問(wèn)題
2) 載體酶切的問(wèn)題
3) 連接片段濃度比的問(wèn)題
在闡明上述問(wèn)題同時(shí),本人盡可能舉些實(shí)驗中的問(wèn)題案例予以說(shuō)明。
一、克隆基因的酶切位點(diǎn)問(wèn)題
1、克隆位點(diǎn)選擇的問(wèn)題。首先要對目標基因進(jìn)行酶切位點(diǎn)掃描分析,列出其所含酶切位點(diǎn)清單。然后對照質(zhì)粒多克隆位點(diǎn),所選擇的克隆位點(diǎn)必須是目標基因所不含的酶切位點(diǎn)。這是常識,不贅述。
2、保護堿基數目的問(wèn)題。在設計PCR引物時(shí),引入酶切位點(diǎn)后,常常要加入保護堿基,這是大家所熟知的。但是保護堿基數量多少,可能被新手所忽視。這種忽視碰可能會(huì )大大影響后續的實(shí)驗進(jìn)展。
一般情況下,普通的內切酶只加入兩個(gè)保護堿基,其內切反應就可以正常進(jìn)行;而有一類(lèi),僅僅只加入兩個(gè)保護堿基,其內切反應就不能正常進(jìn)行,這是因為內切酶不能正常結合DN段上。如NdeI就屬這類(lèi),需要加入至少6個(gè)保護堿基,常用的HindIII也要三個(gè)。
1.電擊轉化時(shí)通過(guò)瞬時(shí)高壓使細胞表面出現微小的孔洞,從而使外源DNA能通過(guò)孔洞進(jìn)入到細胞里面,一般適用于革蘭氏陽(yáng)性細菌或者真核微生物;
熱激轉化是使用鈣鹽或者鎂鹽溶液在低溫狀態(tài)下處理細胞使其處于感受態(tài)狀態(tài),然后通過(guò)短時(shí)熱激使其吸入外源DNA片段,主要應用于革蘭氏陰性細菌。
這些我想你應該懂的。我就不贅述了。
2.大腸桿菌作為革蘭氏陰性細菌,使用一般的化學(xué)轉化即熱激轉化就可以了,為何要勞神費力使用電轉化?轉化的目的不就是簡(jiǎn)單而方便為原則么?正所謂殺雞焉用牛刀?
希望我的回答對你有幫助。
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