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Q-PCR實驗流程
一、①實驗前準備,每天早上到實驗室后,先把超凈工作臺的紫外燈打開15-20分鐘。②超凈臺前做實驗,需佩戴干凈的橡膠手套/一次性薄膜手套,RNA抽提需帶口罩。③取EP管/槍頭時需用鑷子,不可以用使用過的手套直接取用。取完EP管/槍頭后,袋子及時封好。④橡膠手套須放入超凈臺照射紫外,實驗操作過程中不得帶出超凈臺,移液器在一天工作結束后調至最大量程,并用75%乙醇清潔移液器,槍頭盒及超凈臺面。⑤實驗進行的過程中或觀看實驗時,沒有帶口罩不要在超凈臺前講話。
二、總RNA抽提
1)細胞培養(yǎng)皿中細胞樣品用1*PBS洗兩次后,用1ml槍將PBS吸干凈,加入1ml Trizol (Invitrogen)溶液,吹打混勻,并吸至1.5ml RNase free EP管中使細胞充分裂解,室溫靜置5min;
組織樣品用液氮充分研磨,加入1ml Trizol (Invitrogen)溶液,混勻,室溫放置5min使其充分裂解;(管蓋與管壁都需標記樣品名稱)
2)加入200μl氯仿,劇烈振蕩混勻30s,使水相和有機相充分接觸,室溫靜置3-5min;(離心時離心管按順序排放,離心完畢,離心管的順序也按順序排好,與第一步的順序一致)
3) 4℃下,14,000g離心15min,可見分為三層,RNA在上層水相,移至另一個新的RNase free EP管;(用20-200ul的槍吸取上清,吸上清時,槍頭應沿著液面上層吸取上清,槍頭不可碰到、吸到中間層)
4)沉淀RNA:加入等體積異丙醇,輕柔地充分混勻(顛倒6-8次)(不應用振蕩器混勻),室溫靜置10min;
5)4℃下,14,000g離心10min,收集RNA沉淀(如離心后仍不見EP管底部有沉淀,應將EP管放置在-80度冰箱過夜,繼續(xù)在4℃下,14,000g離心10min,收集RNA沉淀),去上清;
6)用75%乙醇洗滌兩次(12,000g離心5min)(加入乙醇后只需輕輕顛倒EP管即可,不用振蕩器震蕩或槍頭吸打沉淀),超凈臺風干;沉淀不能過干或過濕,過干則不易溶解,過濕則乙醇殘留。
7)視沉淀量加入適量DEPC水(至少15ul)溶解沉淀。
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三、去基因組
使用RNase-free的DNase ?(Promega),按以下體系配置反應液,37℃消化30min,65℃滅活10min。
百度百科里有:
Realtime PCR(實時定量PCR)
定量PCR已經從基于凝膠的低通量分析發(fā)展到高通量的熒光分析技術,即實時定量PCR。實時熒光定量PCR技術于1996年由美國Applied Biosystems公司推出,由于該技術不僅實現(xiàn)了PCR從定性到定量的飛躍,而且與常規(guī)PCR相比,它具有特異性更強、有效解決PCR污染問題、自動化程度高等特點。實時定量PCR (real-time quantitative PCR)是指在PCR指數(shù)擴增期間通過連續(xù)監(jiān)測熒光信號強弱的變化來即時測定特異性產物的量,并據(jù)此推斷目的基因的初始量,不需要取出PCR產物進行分離。目前實時定量PCR作為一個極有效的實驗方法,已被廣泛地應用于分子生物學研究的各個領域。
實時熒光定量PCR 技術的主要應用:
1. DNA 或RNA 的絕對定量分析:包括病原微生物或病毒含量的檢測,轉基因動植物轉基因拷貝數(shù)的檢測,RNAi 基因失活率的檢測等
2. 基因表達差異分析:例如比較經過不同處理樣本之間特定基因的表達差異(如藥物處理、物理處理、化學處理等 ),特定基因在不同時相的表達差異以及cDNA 芯片或差顯結果的確證
3. 基因分型:例如SNP 檢測,甲基化檢測等
Realtime PCR 常用的兩種方法分別為:Sybr green(熒光染料摻入法) 和Taqman probe (探針法)
SYBR green
在PCR反應體系中,加入過量SYBR熒光染料,SYBR熒光染料特異性地摻入DNA雙鏈后,發(fā)射熒光信號,而不摻入鏈中的SYBR染料分子不會發(fā)射任何熒光信號,從而保證熒光信號的增加與PCR產物的增加完全同步。
此方法適用:
1、靈敏度高:使用SYBR可使熒光效果增強到1000倍以上
2、通用性好,不需要設計探針,方法簡便,省時,價格低廉。
3、通用型方法,在國內外科研中普遍使用。
4、高通量大規(guī)模的定量PCR檢測
5、專一性要求不高的定量PCR檢測。
Taqman Probe
PCR擴增時在加入一對引物的同時加入一個特異性的熒光探針,該探針為一寡核苷酸,兩端分別標記一個報告熒光基團和一個淬滅熒光基團。探針完整時,報告基團發(fā)射的熒光信號被淬滅基團吸收;PCR擴增時,Taq酶的5'-3'外切酶活性將探針酶切降解,使報告熒光基團和淬滅熒光基團分離,從而熒光監(jiān)測系統(tǒng)可接收到熒光信號,即每擴增一條DNA鏈,就有一個熒光分子形成,實現(xiàn)了熒光信號的累積與PCR產物形成完全同步
此方法適用:
1、具有高適應性和可靠性,實驗結果穩(wěn)定重復性好,特異性更高。
2、適用于擴增序列專一的體系的檢測。
3、樣品中靶基因含量過低的定量PCR檢測。
4、靶基因的特異序列較短,無論怎樣優(yōu)化引物設計條件都不能解決。
5、存在與靶基因同源的序列,在PCR中容易出現(xiàn)非特異性擴增,對特異性要求較高的定量。
6、廣泛用于人類傳染病的診斷和病原定量,在動物病原體基因的檢測,畜禽產品的檢驗檢疫,生物制品的鑒定。
(來源:GENELIFE Biotech 基萊生物)
QPCR 問:什么是QPCR?答:QPCR的英文全名是Real-time Quantitative PCR Detecting System。
即實時熒光定量核酸擴增檢測系統(tǒng),也叫實時定量基因擴增熒光檢測系統(tǒng),簡稱QPCR。問:QPCR、DNA檢測、PCR之間的關系?答:聚合酶鏈式反應(Polymerase Chain Reaction簡稱PCR)原理憑借敏感、特異、快速的特點榮獲93年諾貝爾化學獎。
因其在病原體檢測方面的獨特優(yōu)勢,因而發(fā)達國家在相關方法和儀器方面的研發(fā)非???,成為分子生物學診斷的主流,至今仍處于學術和應用前沿:第一代產品:基因擴增熱循環(huán)儀(DNA Thermal Cycler)+電泳儀+紫外分析儀+定性試劑,構成PCR定性檢測。第二代產品:基因擴增熱循環(huán)儀+熒光儀+終點定量試劑,構成PCR-DNA終點法定量檢測(End-point quantitative PCR detection),又分為終點酶免定量( End-point ELISA-PCR)和終點熒光定量(End-point Fluor-PCR)兩種。
第三代產品:實時定量QPCR儀+實時熒光定量試劑,構成QPCR-DAN/RNA實時熒光定量檢測。問:相比以前的方法,QPCR有哪些特點?答:QPCR至少有以下特點:所用儀器少,只用一臺儀器。
檢測時間短,只須45分鐘~1小時10分鐘(試劑各異),而定性PCR須3~4小時,酶免終點定量須6~8小時,熒光終點定量須2~3小時。操作極其簡單:前處理后,樣本插入儀器一小時后到電腦上來出報告即可,無須開蓋,移樣本(以前方法),避免污染。
結果精確:定性PCR只能定性,很粗略,終點定量PCR由于只能在40個熱循環(huán)結束后檢測熒光,被測熒光達到飽和導致定量不夠精確,屬于半定量狀態(tài)。而實時熒光QPCR是在擴增的每時每刻連續(xù)檢測各樣本的熒光值的變化,如圖一所示: 圖一 西安天隆TL988實際曲線1檢測動態(tài)范圍:10~10000000000 DNA copies/ml檢測精度:0.1RLU辨別率:5000和10,000個模板拷貝樣本的辨別率99.7%。
問:QPCR的技術先進性、價格及應用現(xiàn)狀?答:實時熒光QPCR是當今世界用于臨床的最先進核酸分子診斷技術,被美國FDA承認并推崇,被美國FDA批準并取得臨床應用執(zhí)照的QPCR試劑品種有:HBV乙肝病毒DNA,HCV丙肝病毒RNA,HIV艾滋病病毒RNA,Chlamydi trachomatis(CT),性傳播疾病,沙眼衣原體,Neiserria gonorrhea(NG),性傳播疾病,淋病雙球菌,Cytomegalovirus(CMV),性傳播疾病,巨細胞病毒,Mybobacterium tuberculosis(Mtb),呼吸道疾病,結核分支桿菌等。實時熒光PCR儀研發(fā)技術難度大,門檻高,發(fā)達國家也只有有限幾家知名公司生產,且售價昂貴:如美國ABI/7700-120萬元,美國ABI/5700-50萬元,瑞士Roche/Lightcycler-70萬元,美國Stratagene公司2005年新品MX3005P-80萬元 可見,在病人看來,哪家醫(yī)院應用了QPCR技術便是先進診斷技術的象征,在發(fā)達國家也是如此。
國產儀器情況:國產儀器生產單位不超過五家,其中包括:日本獨資杭州博日實時熒光QPCR儀(33孔)西安天隆科技有限公司TL988實時熒光QPCR儀(48孔) 以上產品均取得國家SFDA認證,報價均在45萬以上。 國產試劑情況:多家公司生產實時熒光QPCR試劑盒,價格與終點法試劑相當,且品種齊全,價格便宜,購買方便:乙肝HBV-DNA,丙肝HCV-RNA,艾滋AIDSHIV-RNA,性病系列:淋病雙球菌NG、沙眼衣原體CT、解脲支原體UU、皰疹病毒HSV、人體乳頭瘤HPV,優(yōu)生優(yōu)育系列:巨細胞病毒CMV、弓形蟲COX等。
編輯詞條 開放分類:病毒、DNA、PCR、分子生物、實時熒光定量PCR儀 參考資料: 1. /pcr%D2%C7 2. 貢獻者:zhang120jing、弦之月NONO。
有五種,分別是:
1、比率分析法。根據(jù)不同數(shù)據(jù)做對比,得出比率。
2、趨勢分析法。根據(jù)一階段某一指標的變動繪制趨勢分析圖。
3、結構分析法。根據(jù)某一指標占總體的百分比來觀察。
4、相互對比法。選取某兩個指標作為一組進行對比。
5、數(shù)學模型法。建造適合某一指標的數(shù)學模型來觀察指標的變化。
以上五種定量分析方法,比率分析法是基礎,趨勢分析、結構分析和對比分析等方法是延伸,數(shù)學模型法代表了定量分析的發(fā)展方向。
拓展資料:
定量分析法(quantitative analysis method)是對社會現(xiàn)象的數(shù)量特征、數(shù)量關系與數(shù)量變化進行分析的方法。在企業(yè)管理上,定量分析法是以企業(yè)財務報表為主要數(shù)據(jù)來源,按照某種數(shù)理方式進行加工整理,得出企業(yè)信用結果。定量分析是投資分析師使用數(shù)學模塊對公司可量化數(shù)據(jù)進行的分析,通過分析對公司經營給予評價并做出投資判斷。定量分析的對象主要為財務報表,如資金平衡表、損益表、留存收益表等。其功能在于揭示和描述社會現(xiàn)象的相互作用和發(fā)展趨勢。
百度百科-定量分析
化學檢測的方法有哪些
一般分有機顏料,如酞青綠等;無機顏料如氧化鐵紅、鈦白;染料如還原桃紅、分散橙等.聚烯烴、PVC色母粒采用的是顏料,一般說染料不可用于聚烯烴著色,否則會引起嚴重遷移.
二、分散劑主要對顏料表面進行潤濕,有利于顏料進一步分散,并穩(wěn)定在樹脂中,同時必須與樹脂相容性好,不影響著色產品品質.聚烯烴色母粒分散劑一般采用低分子量聚乙烯蠟或硬酯酸鋅等.工程塑料色母粒分散劑一般采用有極性低分子量聚乙烯蠟、硬酯酸鎂、硬酯酸鈣等.三、載體樹脂
使顏料均勻分布并使色母粒呈顆粒狀.選擇載體需考慮與被著色樹脂的相容性,還要考慮母粒應有良好分散性,因此載體的流動性應大于被著色樹脂,同時被著色后不影響產品質量.如選用熔體指數(shù)較大的同類高聚物,使母粒的熔體指數(shù)較高于被著高聚物,以保證最終制品的色澤一致.
如果你指的是定量分析化學,分析方法有重量法和滴定法
重量法包括沉淀重量法、氣化法、電解法、萃取法等,重量分析方法適合于常量分析,相對誤差較小,但操作繁瑣,耗時較長。
滴定法包括酸堿滴定、配合滴定、氧化還原滴定、沉淀滴定四種方法。該方法簡便、快速、有足夠的準確度,相對誤差較小,主要用于常量組分測定,但需要特定的指示劑。
有時候吸光光度法也被劃入化學分析的范疇,主要是因為吸光度測定前通常需要一個配合顯色的過程,這是一個化學過程。
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